Четыре миллиона лет назад, на планете под названием Кибертрон, существовала раса Трансформеров — разумных роботов способных думать и осознавать окружающий мир. Эта раса была разделена на два основных клана — автоботы и десептиконы. Автоботы, вместе с их лидером Оптимус Праймом желали мира. Десептиконы под руководством Мегатрона жаждали войны. Оба клана воевали между собой, борясь за превосходство на планете уже много лет.
Из-за войны у обеих рас начала заканчиваться энергия и автоботы создали космический корабль «Арк» для поиска нового источника энергии. Но десептиконы преследовали их и взяли «Арк» на абордаж. В результате схватки оба корабля потерпели крушение на доисторической Земле, «Арк» врезался в бездействующий вулкан, а корабль десептиконов рухнул в океан. Четыре миллиона лет роботы на «Арке» находились в деактивированном состоянии, пока в 1984 году вулкан не пробудился и не включил бортовой компьютер «Телетрон 1». Компьютер начал ремонтировать роботов и заодно сканировать местную технику, чтобы трансформеры могли замаскироваться в этом мире. Автоботы стали трансформироваться в земные автомобили, а десептиконы - в военные самолёты.
Автоботы и десептиконы продолжили войну между собой на Земле. Десептиконы стремились забрать все ресурсы с Земли и превратить их в энергон, а Автоботы мешали им, защищая Человечество. Этот период позже был назван трансформерами «Великой войной». Эта война могла бы очень быстро закончиться, так как Десептиконы, не встречая действенного сопротивления со стороны землян, весьма преуспели в похищении ресурсов и смогли отремонтировать свой космический крейсер, но вмешательство автоботов помешало им сбежать с Земли.
После этого случая обе стороны обзавелись новыми союзниками. Друзьями автоботов стали первые, встреченные ими люди - нефтяники Спаркплаг Витвики и его сын Спайк Витвики. На Земле были обнаружены другие трансформеры: Истребитель (Джетфаэр) и Инсектиконы. Также обе стороны построили новых роботов — Автоботы сконструировали диноботов и аэроботов, а Десептиконы — эффектиконов и боевиконов. Позже прибыло подкрепление с Кибертрона, среди них были Омега Суприм и Конструктиконы.
Несмотря на дикие выходки Трансформеров, среди которых были попытки построить совершенное оружие, путешествия во времени и временное телепортирование Кибертрона на орбиту Земли, ни одна из сторон не смогла достичь победы. Хотя десептиконы проигрывали практически каждую серию, они смогли построить космический мост, позволяющий телепортировать ресурсы и роботов с Кибертрона и обратно, что дало им немалое преимущество в войне.
В 2005 году, на 20 году Великой войны, Десептиконы предприняли внезапную атаку на Город автоботов. Некоторые трансформеры погибли, но десептиконов удалось оттеснить. Произошло это благодаря победе Оптимус Прайма над Мегатроном, но сделал он это, пожертвовав собственной жизнью.
Мегатрон и другие раненые десептиконы были оставлены более сильными членами команды, в основном из-за желания Скандалиста избавиться от Мегатрона как лидера Десептиконов. Богоподобный Юникрон, исполинский робот, бороздящий космос в поисках планет, которые служат ему пищей, нашёл обломки десептиконов в космосе. Он восстановил Мегатрона и назвал его новую сущность Гальватроном, для того чтобы Гальватрон нашёл и разрушил Матрицу автоботов - единственное оружие, которое способно остановить Юникрона. Новый лидер Автоботов, Родомес Прайм, был в состоянии остановить Десептиконов навсегда. В первой же схватке он уничтожил Юникрона, освободил Кибертрон для автоботов и отправил Гальватрона глубоко в космос.
Десептиконы, оставшись без командира и с низким уровнем энергона, отступили к сожжённой планете Чарр. Они находились там до тех пор, пока Циклон не обнаружил, что Гальватрон не был уничтожен. После возвращения Гальватрона, десептиконы вновь атаковали автоботов с целью захвата Кибертрона.
В это время и у автоботов, и у десептиконов появился новый враг. До тех пор малоизвестная раса Квинтессоны приготовилась к полному уничтожению Трансформеров. Позже Родомес Прайм узнал, что квинтессоны были создателями первых трансформеров, а Кибертрон был их фабрикой задолго до того, как он стал домом трансформеров. Квинтессоны настолько хотели уничтожить трансформеров что решили разрушить Кибертрон. Но всё же они были повержены уже взрослым Спайком Витвики, так как теории исследования вероятности и общей логики квинтессонов, не смогли предугадать эмоциональные действия человека.
После победы над квинтессонами война между автоботами и десептиконами разгорелась с новой силой. Но теперь она шла в основном не на Земле, а во многих районах Галактики.
В 2006 году во Вселенную была выпущена Чума Ненависти. Эта болезнь могла поразить и человека, и трансформера, угрожая уничтожить всё. В конечном итоге Родомес Прайм был заражён и Бравый (Скайлинкс), последний уцелевший из руководителей автоботов был вынужден отдать Матрицу квинтессонам. Квинтессоны смогли починить Оптимус Прайма, и тот с помощью Матрицы остановил чуму. Сила Матрицы после этого иссякла навсегда.
Оптимус Прайм вновь стал лидером автоботов и поклялся сдерживать десептиконов вечно.
Происхождение трансформеров
Создание квинтессонами
Одна из версий происхождения расы трансформеров гласит о том, что 11 млн. лет назад планету Кибертрон населяла раса квинтессонов. Это были высокроазвитые механизированные существа. В ходе научных исследований они открыли новый источник энергии — энергон, который во много раз превышал все существущие аналоги. Первое время к нему относились с опасением, тщательно изучали. Было обнаружено особое излучение, испускаемое энергоном, однако в итоге оно было признано безопасным для живых организмов и механизмов. В то время квинтессоны активно использовали первые прототипы трансформеров. Именно то загадочное излучение повлияло на кремниевые процессоры обычных пилотируемых роботов, подарив им разум.
Жестокие квинтессоны начали производство роботов двух типов: боевые роботы-гладиаторы (десептиконы), которых заставляли сражаться между собой ради развлечения хозяев, и роботы-рабочие (автоботы). Долгое время длился гнет над разумными машинами, пока они не восстали против своих хозяев. Началась Первая Кибертронская война, в ходе которой квинтессоны потерпели поражение и были изгнаны с планеты.
Наступила эпоха мира… Автоботы продолжили заниматься строительством и наукой, а десептиконы стали воинами, защитниками планеты Кибертрон и стражами порядка. Однако, автоботы и десептиконы были слишком разными по своему образу жизни, мышлению, философии. Конфликт все время накалялся, пока не перешел в открытую борьбу за власть. Так началась Вторая Кибертронская война, в ходе которой автоботы изобрели технологию трансформации, которая позволила роботам менять свою форму (в некоторых случаях и размер), быстро перестраивая их в оружие/транспорт. Также автоботам удалось использовать оставшихся от квинтессонов гигантских роботов-защитников (стражников). Благодаря этому над десептиконами была одержана временная победа, и автоботы перестали воспринимать их как серьёзную угрозу.
Всё изменилось, когда у десептиконов появился новый зловещий лидер - Мегатрон. Воспользовавшись беспечностью противника, он создал большую армию и развязал Третью Кибертроновску войну, которая длится до сих пор.
Создание Праймусом
Другая теория утверждает, что история трансформеров началась с двух первых трансформеров-гигантов — Праймус и Юникрон, абсолютное Добро и Зло, враждущие друг с другом. После поражения Уникрона, Праймус пожелал стать новой планетой и перестроил себя в Кибертрон. Он же и создал расу трансформеров.
